判断は、治療を続けていれば症状はほぼ安定し一般枠の仕事も有休などの会社の制度だけで問題ないかどうか、にあるように思います。仮に再発、再燃を経験している場合、よっぽど休職制度が充実しているところでないとリスクが大きいように思います。障害者雇用だけだと生活は厳しいですから、そこに障害年金もプラスできると安心感があります。障害年金はハードルが高いので、事前に主治医に相談するとよいかと思います。
障害者枠では働いたことないけど、特例子会社なら一般企業が障害者のための子会社を作って仕事してるわけだから、健常者の中に障害者枠で入るよりも特例子会社に入ってある程度障害のことを理解してくれる方達の中で働いた方が少しは気が楽かもしれないね。