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口や喉など体に異物を取り入れる器官に病的炎症が起こると、全身の免疫の動きが決定されてしまい、体のさまざまな部位に異常が起きること。慢性上咽頭炎、歯周病などが病巣炎症を引き起こすとされる。
例：慢性上咽頭炎からのIgA腎症 等
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