ファンネルジェガンのパイロットは、主に以下のキャラクターが知られています。 ジュドー・アーシタ: 『機動戦士ガンダムZZ』の主人公であり、ファンネルジェガンを操縦します。 シーブック・アノー: 『機動戦士ガンダムF91』に登場し、ファンネルジェガンを使用する場面があります。 これらのキャラクターは、ファンネルジェガンの特性を活かして戦闘に参加しています。