綾波レイがサヨナラって言った時に「サヨナラなんて悲しいこと言うなよ」って言ってるからシンジにとっては悲しい言葉なんだけどアヤナミレイにとったら「また会えるおまじない」だからポジティブな意味なんだよね。多分そこですれ違っててグッときました。